山杏种子MATE家族分析及其重要成员MATE40克隆表达

来源 :生物技术通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qq616009003
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
山杏种子中的苦杏仁苷极大限制其油脂及其他相关产品的开发利用,而多药和有毒化合物排出(multidrug and toxic compound extrusion,MATE)转运蛋白可能在苦杏仁苷转运过程中起重要作用.运用生物信息学方法对山杏种子PsMATE家族成员进行预测分析,采用qRT-PCR技术对其在发育种子中的表达模式进行分析测定;利用qRT-PCR技术对PsMATE40进行组织特异性表达分析,使用GFP融合蛋白表达法对其进行亚细胞定位分析.基于实验室前期获得的山杏种子转录组数据,利用功能注释及生物信息学分析确定17个山杏种子PsMATE基因家族成员,可分为3个亚家族:亚家族1、亚家族2与亚家族4;上述基因编码蛋白二级结构以α-螺旋为主,含多个磷酸化位点;除PsMATE23、PsMATE33、PsMATE35A与PsMATE35B蛋白为酸性蛋白外,其余均为碱性蛋白;15个PsMATE蛋白为强疏水性跨膜转运蛋白,定位于质膜.qRT-PCR分析显示,PsMATE家族成员在山杏发育种子中均有表达,但不同发育期表达量差异显著,其中PsMATE40表达量在该家族基因中最高;结合系统发育结果,PsMATE40与已被鉴定具有苦杏仁苷转运的MATE蛋白聚类在一起,据此推测PsMATE40基因在山杏种子苦杏仁苷的转运中起重要作用;成功克隆获得PsMATE40基因序列;qRT-PCR分析表明,PsMATE40基因在山杏种子中表达量最高而在根中最低,表明PsMATE40表达具有组织特异性;构建植物表达载体pBI121-GFP-PsMATE40并瞬时转化烟草叶片,荧光显微镜检测PsMATE40转运蛋白定位于质膜.研究结果为阐明山杏种子苦杏仁苷的跨膜转运原理及分子定向培育低苦杏仁苷含量的油料植物奠定重要基础.
其他文献
为开发沙漠砂代替土壤作为羊肚菌栽培基质,研究羊肚菌栽培对沙漠砂中微生物群落及基质理化性质的影响.利用扩增子测序分别检测栽培与未栽培羊肚菌的沙漠砂中细菌、真菌群落,解析总有机碳、腐殖质和氮素含量等理化性质.收获子实体产量(1210±259)g/m2鲜重,说明沙漠砂栽培羊肚菌可行.沙漠砂基质中微生物多样性在羊肚菌栽培过程中短暂下降,在羊肚菌出菇采收后回升.真菌群落以子囊菌门为主.随着羊肚菌在沙漠砂中增殖,扫描电镜观察到大量菌丝形成网络状缠绕固定沙漠砂颗粒.细菌群落以变形菌门、放线菌门、拟杆菌门为主.假单胞菌属
维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,A.veronii)是一种新型病原体,既能感染鱼类,又可以感染包括人在内的哺乳动物,其致病机理尚不完全清楚.基于A.veronii C4野生型菌株转录组数据一个新的sRNA N155被鉴定,进一步利用同源重组等分子生物学手段构建了sRNA N155的缺失菌株.转录组数据和RT-qPCR分析结果表明,sRNA N155独立转录.序列比对分析发现,sRNA N155具有物种特异性,仅存在于气单胞菌属中.生长曲线测定和运动性实验结果表明,sRNA N155的敲除
为探究茉莉酸在提高植物抗旱性方面发挥的重要作用.对橡胶草外施茉莉酸甲酯(MeJA)处理的转录组进行差异表达谱分析,并筛选克隆出一个受茉莉酸诱导表达显著上调的AP2/EREBP亚家族基因DREB,命名为TkDREB2,对其进行生物信息学分析并转化烟草,进一步对TkDREB2转基因烟草植株在发育期的抗旱性功能鉴定,对转基因烟草进行自然干旱处理,并测定相关生理指标.结果显示在茉莉酸甲酯处理的转录组分析中发现与茉莉酸合成相关的基因和转录因子AP2/EREBP、MYB、MYC、NAC和WRKY的表达水平发生显著变化
探索西藏林芝与山南地区沙棘根瘤及其根际土壤样品中放线菌的多样性及抗菌活性,为天然产物药物研发提供新的微生物资源.采用稀释涂布法对10份样品中可培养放线菌进行分离,后经菌株16S rRNA序列测序,以邻接法(neighbor-joining method,N-J)构建系统发育树分析放线菌种属多样性;利用微孔板法对代表性菌株进行发酵培养及抗菌活性评价;进一步利用超高效液相色谱-质谱联用(UPLC-MS)考察活性菌株代谢产物情况.从10份样品中分离到112株放线菌,分属于7个目12科23个属,优势菌属为链霉菌属
银耳胶是一种经简易浸提工艺所制得的新型食品添加剂,主要成分为银耳多糖.本研究制备了两种不同的黄原胶-银耳胶(XG-TFG)和瓜儿豆胶-银耳胶(GG-TFG)的复配胶溶液并分析了两种单胶体(XG、GG)及其复配胶溶液在不同理化条件下的表观黏度和流变学特性,并比较了添加不同比例复配胶酸奶的感官评价.结果表明所有胶体溶液的表观黏度随胶浓度的增加呈现非线性增长;离子种类和浓度对XG-TFG复配胶表观黏度的影响显著小于XG单体胶;此外,复配胶表观黏度在弱酸和弱碱环境中保持稳定,但会在较低加热温度下随加热时间增加而下
沙门氏菌是一种常见的食源性致病菌,由沙门氏菌引起的食源性疾病位居榜首.荧光定量聚合酶链式反应(fluorescence quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)是一种准确、可靠的用于核酸定量的扩增技术,常用的荧光探针法使得扩增体系复杂、引物合成成本高.为了简化FQ-PCR的扩增体系,减少标记基团的修饰,拟通过单标记的荧光自淬灭引物实现新型荧光定量聚合酶链式反应(innovative FQ-PCR,IFQ-PCR)用于模板DNA的定量检测.根据沙门氏菌特异
高寒湿地土壤微生物对全球气候变化十分敏感.为研究青藏高原高寒湿地土壤产甲烷菌群落对降水变化的响应,本研究设置了5种降水梯度,即自然降雨、减少自然降雨的25%和50%以及增加自然降雨的25%和50%.利用mcrA基因进行高通量测序分析土壤产甲烷菌的群落结构及多样性.高寒湿地产甲烷菌优势菌目为甲烷微菌目、八叠球菌目及甲烷杆菌目.增雨处理显著降低了产甲烷菌菌群的相对丰度以及多样性指数,减雨处理显著增加了产甲烷菌菌群的相对丰度以及多样性指数.产甲烷菌群落组成对增减雨50%处理的响应更显著,仅甲烷丝菌属和甲烷杆菌属
畜禽粪便和秸秆等农业有机废弃物中存在大量具有致病风险的人体和动植物病原菌,好氧堆肥高温期对病原菌的消减效果和影响病原菌存活的理化因子需探明.首先检测了市售25种商品有机肥料中病原菌存活的情况;其次考察了好氧堆肥高温阶段病原菌的灭活效果,并探究温度、pH、铵浓度对2种模式病原菌(大肠杆菌与青枯菌)存活的影响.调查的25种商品有机肥中有3个样品检测出存活的潜在病原菌,表明市售商品有机肥仍存在环境风险.好氧堆肥高温期对病原菌的灭活试验表明,高温期后堆体中仅检测出丰度极低的病原菌DNA.室内试验表明随着温度的升高
技术市场是我国现代市场体系和国家创新体系的重要组成部分,技术市场成交额的准确预测对于政府部门制定科技发展规划和政策措施具有重要意义.针对线性回归模型、GM(1,1)模型存在的固有缺陷和传统组合预测模型多次建模复杂性高的问题,通过构建新陈代谢灰色线性回归组合模型,实现了对我国技术市场成交额的动态预测.实证分析的结果表明,灰色线性回归组合模型较线性回归模型和GM(1,1)模型取得了更好的预测精度,而新陈代谢灰色线性回归组合模型较传统灰色线性回归组合模型表现更优,且预测结果显示我国技术市场成交额将继续保持快速增
Whirly转录因子广泛存在于植物中,参与植物生长发育进程和逆境胁迫耐受,对其功能的研究有助于我们理解雨生红球藻响应胁迫的机制.因此,先根据雨生红球藻192.80转录组测序数据,分离克隆到一个Whirly转录因子序列,并对其结构及表达进行分析.该转录因子的cDNA序列为924 bp,基因组序列为2556 bp,由有5个外显子和4个内含子组成,命名为HpWhirly1.HpWhirly1预测由244个氨基酸组成,拥有Whirly转录因子的保守结构域.HpWhirly1在醋酸钠和水杨酸胁迫早期表达上调,在强光