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对海南的3种土白蚁15个不同地理种群的线粒体COⅡ基因进行了克隆鉴定和序列分析,并结合GenBank中的数据,构建进化树进行遗传变异分析.结果表明,3种土白蚁种间同源性为92.5％～95.1％,遗传分歧为5.1％～8.1％;黑翅土白蚁和海南土白蚁COⅡ基因不同种群之间的同源性分别为97％～99.9％和98.4％～ 100％,遗传分歧分别为0.1％～3.0％和0％～1.6％.崖城的一个未知种群Odontotermes sp.与来自日本的O.javanicus同源性最高（95.4％）.土白蚁COⅡ基因序列中A