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不整合既可以对油气藏的形成起到重要作用，也可以使已形成的油气藏遭到破坏。通过理论及实例分析，阐述了不整合对油气藏的破坏作用。不整合的形成导致油气藏直接或间接暴露于地表，发生各种稠变作用（生物降解、水洗、氧化和逸散等），使油气藏遭到破坏；不整合可延缓甚至中断烃源岩的生烃作用，进而影响油气藏的规模；不整合能否重建形成封闭作用也影响和控制着油气的晚期成藏。