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国家工程研究中心项目面临着国有股股权主体的界定不明确，科研转化成果慢，经营能力不强，配套资金和后续投入不足以及设备闲置率偏高等问题。本文分析了这些问题形成的原因，提出应尽快明确国有股股权的代表、在国家工程研究中心内部组建研发机构和转制公司、加大国家科技项目的经费投入，以及加强设备的管理工作等对策。