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通过构建自主创新能力评价指标体系,选取创新投入能力、创新成果转化能力、创新效益、创新环境支撑以及创新产出能力五个一级指标,在对数据进行无量纲化的基础上,对芜湖市融入长三角区域研发联盟自主创新能力进行评价分析。结果表明芜湖市自加入长三角区域研发联盟后,自主创新能力有一定程度的提高,但同时也面临着阻力,在此基础上提出了建立研发资源共享机制、转变政府职能等政策建议。