一种新的EST聚类方法

来源 :遗传学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiang43
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
该研究发展了一种EST(expressed sequence tag)聚类方法(ESTClustering),用于分析大规模EST测序中所产生的大量数据,以获得高质量、非重复表达序列.该方法在聚类过程中采用MEGABLAST工具对一致序列进行序列同源比较,并用phrap程序对每一EST簇进行拼接检验.这一聚类策略能降低测序错误带来的影响,有效识别基因家族成员,并避免选择性剪接的干扰.与NCBI(National Center for Biotechnology Information)的UniGene c
其他文献
亚当·斯密视野中的“经济人”具有按照理性追求自身利益最大化的根本特征,然而,这种“经济人”的自利行为存在着固有的道德限度,同时还蕴涵着深厚的伦理价值,不但成就了新经
玉米是抚松县主要粮食作物,它是发展畜牧业的主要饲料源,在提高人民生活水平和维护粮食安全方面也有着非常重要的作用。但是玉米在种植过程中常常会受到种子、病虫害及技术等
信息技术迅速发展,高等院校非常注重信息化教学在各个教学领域之内的应用计算机实验室,其作为信息化教学的必备场所和机械基础,在高校计算机发展的信息化应用中也具备着非常
随着素质教育的开展,体育教师素质的培养也成为教育领域一个十分重要的问题。就当代体育教师应具备的道德素质、心理素质、知识素质、能力素质及教育观念等进行探讨。
采用银染mRNA差异显示方法从绍鸭卵巢等级卯泡中分离并筛选到3个差异表达序列标签(ExpressedSequence Tags,ESTs)SXDF0201(271 bp)、SXDF0202(200 bp)和SXDF0203(173 bp),通
目的探讨产科病房管理中的不安全因素分析及对策。方法针对产科病房的不安全因素进行分析,并制定针对性较强的预防干预方案。结果对产科病房管理中存在的不安全因素进行早期
以TM543波段组合RGB近自然的色彩对南宁市进行三个不同时像的遥感粗分类。探讨遥感影像经过主成分分析后采用决策树方法逐层提取林地、耕地、草地、水体、道路、城镇、其他类等基本地物类型,后又用决策树的方法将分类好的单个地物逐层合并成一张分类图。对同一地区的三个不同时像的遥感图像进行比较,研究证明决策树方法简单、直观。
用G-box家族引物对小麦光温敏核雄性不育系农大3338在可育与不育光温条件下进行mRNA差异显示,结果表明,在育性转换时期,这两种条件下的基因表达存在显著差异.回收了12个质的
自行设计一对引物,从质粒pUC18上扩增一段无启动子和信号肽的β-内酰胺酶基因(△P△SP Amp),以作为最终构建的载体克隆到带跨膜信号基因片段的报告基因.所设计的上游引物中依
利用Sobolev-Hardy不等式、集中紧原理、山路几何给出关于Sobolev-Hardy指数的含奇性p-拉普拉斯方程:-div〔(|▽u|p-2▽u)/|x|β〕=(up*-1)/|x|α+λuq-1,inΩ;u=0,onΩ