内部会计制度是社会经济发展到一定阶段的产物，是现代企业管理的重要手段 。有关企业经营的失败 、会计信息失真 、违法经营等情况的发生在很大程度上都可以归结为企业内部会计制度的缺失或失效 。我国的会计工作只注重其核算功能，未能发挥管理的基本职能 。目前，我国在企业内部会计制度建设方面主要存在以下几个问题：
　　一、企业内部会计制度不健全
　　企业内部会计核算和岗位制度不完善，甚至部分企业根本没有制定内部会计制度 。这些企业直接以企业会计准则和行业统一的会计制度 、企业财务通则以及上级发的各种文件作为企业内部会计制度，企业财务管理力度明显不足，这就会出现挤占成本 、虚报成本 、数据虚假 、会计失真的情况，致使企业日常会计核算工作随意性过强，直接影响到会计信息的质量，影响会计决算的正确性 。一些企业在设计内部会计制度时，没与充分考虑到它的系统性和可操作性，从而无法使内部会计制度真正融会 、贯穿于企业管理制度的各个方面，使得它不能有效运转 。因为大多数企业认为本企业经营业务少，资金往来单一，不需要建立内部会计制度 。
　　还有一些企业只注重其形而忘其实，草草建立一套内部会计制度主要用以应付上级检查，而没有起到实质性作用，因此，内部会计制度没有得到真正贯彻和执行 。如珠海市跃华石油化工公司由辉煌转向衰落的主要原因之一便是企业内部会计制度管理混乱，经济业务不依据会计制度进行反映和监督，账目记录混乱，无法确认资产 、收入 、支出的数额，导致公司走向破产 。
　　内部会计制度是企业的一种经济政策。根据企业发展理论，企业在其生命周期的不同阶段，都会采用不同的经济政策，即使在同一生命周期上，面对不同的市场也会选择不同的经济政策，如扩张政策、收缩政策 。企業经济政策的实现，需要多种条件配合 。企业内部会计制度为企业经济发展起决策支持作用，为经济政策的实施保驾护航 。作为企业内部制度，应该具有一定的稳定性，但随着会计政策的变化企业内部会计制度也应该配合不同的经济政策作出选择 。会计系统对企业经济政策的制定和实施提供信息支持，内部会计制度保证会计信息的有用性，属于企业经济政策中不可缺少的内容。
　　二、企业内部会计业务缺乏监督
　　良好的内部稽查结合一定的审计方式可以在企业内部各职能部门、各相关工作人员之间以及在处理经济业务过程中形成相互联系、相互制约的一种管理制度，可以保证企业业务活动的有效进行，保护财产安全和完整，防止、发现并纠正错误与舞弊，保证会计资料的真实、合法、完整。
　　而目前，很多企业在制定内部会计制度时，未能有效的贯彻内部审计制度，这样就无法确保管理部门制定的方针政策得到实施，无法保证管理信息的准确可靠和财产的安全完整。很多企业往往认为一旦建立起内部会计制度，便可以顺利实施，而缺乏必要和有效的监控，内部会计制度只能形同虚设，很难严格执行下去。
　　三、企业财务人员素质不高
　　一些企业普遍存在着会计人员素质较差、不具备相应的专业知识和职业道德欠缺的情况。据统计在我国1 200万会计人员中，受过正规教育的人比重偏低，会计人员的素质可见一斑。同时职业道德水准也较低。有些会计人员置会计的真实公允性于不顾，为迎合某些特定需要而制造虚假会计信息，侵害他方合法利益，缺乏主动性和创造性。会计人员往往只局限于对已发生经济业务的核算、报告，参与管理的意识淡薄，会计的作用得不到全面发挥 。究其原因，一方面是单位领导不够重视，另一方面会计人员没有树立经营观念和市场观念，更主要的则是会计人员缺乏内在动力。
　　四、企业外部缺乏监督
　　相关部门和机构没有很好地监督检查企业建立健全内部会计制度的执行情况也是导致企业内部会计制度混乱的原因，尤其会计师事务所及注册会计师不能正确处理诚信与效益的关系，一味追求效益原则而忽视诚信和职业道德。国家审计署于2001年对16家具有上市公司年度报表审计资格的会计师事务所一年内的审计业务质量进行检查时发现，注册会计师审计业务质量存在不符合客观公正原则的现象，其中有14家出具严重失实的审计报告，严重背离了注册会计师应具有的职业道德要求。
　　总之，良好的企业内部会计制度虽然是正确处理公司的利益相关者关系、完善公司治理的重要保证。然而从我国现状来看，企业内部会计制度建设的相关理论研究薄弱，财会人员严重缺乏相关知识和技能，企业内部会计制度实务与经济管理的要求相比存在较大差距等问题日益突出。因此，建立科学、合理 、使用的企业内部会计制度是会计理论和实务界必须要解决的一大问题。