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人的肠道中栖息着大量微生物,在消化吸收、能量代谢、免疫调节、抗病能力等方面发挥着重要作用,与很多疾病的发生发展相关.研究肠道菌群对临床治疗具有非常重要的意义.本综述着重论述聚合酶链式反应技术(polymerase chain reaction,PCR)、基于PCR基础上的16S r DNA指纹图谱技术、荧光原位杂交、基因芯片、宏基因组测序技术等多种分子生物学技术在肠道菌群研究方面的应用,并对未来肠道菌群方面的研究进行展望,希望为临床研究提供参考.