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采用RAPD分子标记技术分析了我国沿海五个海区(大连、威海、青岛、温州、福州)鼠尾藻种群的遗传多样性。从60条随机引物中筛选出21条引物,对五个鼠尾藻种群共150份DNA样本进行了扩增,共检测到207个有效位点,多态位点达89.5%,Nei基因多样性指数(H)为0.2966,Shannon信息指数(I)为0.4508;种群间的遗传分化系数(Gst)为0.6131,基因流(Nm)为0.3155。AMOVA分析表明Fst为0.6185。我国沿海鼠尾藻种群遗传多样性较低,遗传分化水平较高。