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近年来高校科研经费腐败案件频发。从高校科研经费腐败发生的制度性因素而言，其主要包括了如下三个方面：高校科研项目制度设计违背市场分配机制、既有高校科研经费管理制度违背科研活动规律、高校科研项目管理机制本身具有不透明性和脱节性。对于高校科研经费腐败的预防，应承认科研项目中的差别劳动，注重财务管理与项目管理的对接，尝试引入第三方评估机构。