狗枣猕猴桃锌指蛋白的生物信息学分析

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为狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkZFP)功能的生产应用提供参考,利用生物信息学工具和方法,对锌指蛋白的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明:AkZFP的cDNA全长为788 bp,编码区(CDS)为678 bp,由226个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白,属于ZF-C2H2-6蛋白家族(PFAM 13912),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,包含1个植物特有的QALGGH序列锌指C2H2型结构域,与其他20种植物的ZFP氨基酸序列进行对比
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