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目的：探讨在透明细胞肉瘤（CCS）石蜡包埋组织中检测EWS-ATF1融合基因的可行性及EWS-ATF1融合基因表达在透明细胞肉瘤诊断中的意义。方法：收集1992年～2006年期间确诊的26例CCS石蜡包埋组织标本,20例非CCS石蜡包埋组织标本为对照组,β-肌动蛋白和β2微球蛋白作为内参照,用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）和巢式PCR检测EWS-ATF1融合基因的表达;过氧化物酶染色（SP）方法对26例CCS石蜡组织标本进行免疫组化染色,检测S-100、HMB-45蛋白的表达。结果：26例标本中,有2