皱皮香猪3个基因组拷贝数变异的多态性分布

来源 :中国畜牧杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hetongzhixia

【摘要】

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为探究皱皮香猪个体产生皮肤变异的根本原因,本文基于重测序数据,采用生物信息学分析皱皮香猪基因组中的拷贝数变异(CNV),通过荧光定量 PCR 方法检测皱皮香猪中 3 个 CNVs 的

【作者】

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王州冉雪琴牛熙李升黄世会王嘉福

【机构】

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贵州大学动物科学学院,铜仁学院

【出处】

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中国畜牧杂志

【发表日期】

：

2019年6期

【关键词】

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皱皮香猪拷贝数变异多态性皮肤剂量效应 Wrinkled Xiang Pigs Copy number variation Polymorphism Sk

【基金项目】

：

国家高技术研究发展计划(863 计划)(2013AA102503),国家自然科学基金(31672390),贵州省“百”层次创新型人才项目(黔科合人才2016-4012 号),贵州省农业攻关项目(黔科合支撑[2017]2585、[2017]2587、黔科合NY[2013]3073 号),贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才〔2019〕5615).

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为探究皱皮香猪个体产生皮肤变异的根本原因,本文基于重测序数据,采用生物信息学分析皱皮香猪基因组中的拷贝数变异(CNV),通过荧光定量 PCR 方法检测皱皮香猪中 3 个 CNVs 的拷贝数变异规律,并与香猪和大白猪进行比较。结果表明:3 个 CNVs 在猪群中的拷贝数变异呈现出多态性变化,皱皮香猪中CNV1以拷贝数缺失型为主,其中的 MPC1和 RSK3基因可能与脂肪沉积有关;皱皮香猪 CNV2和 CNV3以拷贝数增加型占优势,其中的 CCL17和 CX3CL1基因参与皮肤等组织的炎症反应,可能通过剂量效

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