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对1999—2011年我国水稻新品种权的申请与授权情况进行了统计和分析。结果表明，我国水稻新品种权无论在申请量还是授权量上都有了较快的增长。目前，水稻新品种权保护中存在知识产权保护意识薄弱、新品种权的审查速度较慢、发生侵权后维权困难、常规水稻授权品种推广面积偏小、种子企业自身科研与育种力量比较薄弱等问题。针对这些问题提出了相应的建议与对策。