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以地桉ＤＮＡ为材料，对Idaho Rapidcycler扩增仪上用薄壁管进行ＲＡＰＤ扩增的程序进行了优化研究，通过逐步对退火、延伸和变性的温度和时间及总的循环次数设置不同梯度和亚梯度，比较不同梯度和亚梯度的扩增结果，确定优化程序为：９３℃预变性１min；再４０次循环：９３℃变性２０s,38℃退火２１s, 7２℃延伸７min。该程序的扩增时间较短，具有较好的特异性和重复性。另外，薄壁管反应架在反应室的内位比同时扩增的外位效果差，扩增时只能利用外位。