【摘 要】
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植物抗病R基因在植物抵抗细菌、病毒、真菌等病原体过程中发挥重要作用,NBS-LRR类基因是R基因中最大的一类.三浅裂野牵牛作为甘薯的近缘野生种,是甘薯育种重要的抗病基因资源
【机 构】
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福建农林大学,作物生物技术福建省高校重点实验室,福州,350002;福建农林大学农学院,福州,350002;福建农林大学生命科学学院,福州,350002;福建农林大学农学院,福州,350002;福建农
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植物抗病R基因在植物抵抗细菌、病毒、真菌等病原体过程中发挥重要作用,NBS-LRR类基因是R基因中最大的一类.三浅裂野牵牛作为甘薯的近缘野生种,是甘薯育种重要的抗病基因资源.本研究对三浅裂野牵牛基因组序列使用Snap软件预测全基因组蛋白质序列,应用生物信息学方法在蛋白质序列中鉴定和分析NBS-LRR家族基因,得到三浅裂野牵牛NBS-LRR家族基因的数量、染色体上的分布图、结构域特点和进化树.从三浅裂野牵牛的110 626个基因中,筛选到361个编码NBS-LRR类蛋白的基因,其中N型50个,NL型128个,TNL型46个,CNL型136个,RNL型1个.三浅裂野牵牛的15条染色体上均分布有NBS-LRR家族基因,基因最多的染色体有51个,最少的有2个,共有58个基因簇,包含了 53.7％的NBS-LRR家族基因.CNL亚家族在NB-ARC结构域有7个保守结构域,TNL亚家族有10个保守结构域.本研究对三浅裂野牵牛的NBS-LRR家族基因的鉴定与分析,为后续研究抗病基因功能与甘薯抗病的分子育种提供重要参考.
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