目的：分析贫困地区乡镇卫生院实验室质量控制和质量管理体系对儿童贫血率的影响。方法：依托国家营养包项目，针对柳州市融水县20个乡镇卫生院存在的实验室检测结果出现偏倚等问题，通过在20个卫生院建立实验室示范点，开展实验室质量控制和建立质量控制体系，组织参加室间质评，以点带面，提升全县乡镇卫生院实验室检验水平，降低6～24月婴幼儿贫血患病率。结果：通过建立质量控制及质量管理体系，2017—2018年生化指标（血糖、血脂）、血细胞分析(平均血红蛋白浓度、血红蛋白、血小板、红细胞压积)成绩合格率逐渐提高(P＜0.05)；通过建立质量控制及质量管理体系，2017—2018年生化指标分析总体成绩合格率逐渐提高(P＜0.05)；白云、三防、拱洞、香粉、永乐20个示范乡镇卫生院在2017—2020年分别有701、725、712、708婴幼儿参与营养包干预。营养包干预后，2017—2020年贫血率分别为17.7%(124/701)、15.9%(115/725)、11.7%(83/712)、10.2%(72/708)，贫血率呈逐年下降趋势(P<0.001)，其中2019—2020年婴幼儿贫血率均低于12%，达到《中国儿童发展纲要（2011-2020年）》的要求。结论：通过建立乡镇卫生院实验室质量体系可以提升基层实验室检验质量水平，保证检验结果的准确性和科学性，促使《中国儿童发展纲要（2011-2020年）》在贫困地区的顺利实施，应极力推广。