儿童肝移植术后药物代谢差异相关mRNA及lncRNA的高通量测序分析

来源 :中华器官移植杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hjlcd
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目的

用高通量二代测序(nextgenerationsequencing,NGS)分析儿童肝移植供肝标本的长链非编码RNA(lncRNAs)及mRNA的表达情况,寻找差异表达的lncRNA以及药物代谢基因mRNA,为儿童肝移植免疫抑制剂个体化指导提供依据。

方法

收集2016年10月至2017年12月亲属活体肝移植的供肝组织标本10例,根据术后药物代谢情况分为快代谢和慢代谢两组(各5例),进行mRNA和lncRNA高通量测序。对差异基因进行功能通路分析,并通过靶基因预测筛选关键基因。

结果

慢代谢组与快代谢组中有908个mRNA和1 228个lncRNA的表达差异有统计学意义(P<0.05),其中表达丰度高且差异显著的药物代谢相关mRNA有40个,22个上调,18个下调;lncRNA有37个,13个上调,24个下调。除经典药物代谢相关基因CYP3A5之外,我们还发现CYP2C19、CYP1A2、UGT1A1可能对他克莫司的代谢产生影响作用。同时lncRNA中NONHSAT108 617.2可能靶向调节CYP3A5基因的表达。

结论

本研究全面分析了儿童亲属活体肝移植供肝标本中lncRNA及mRNA的表达特征,其中一些差异的药物代谢相关基因可能共同作用影响他克莫司体内代谢,进而对术后免疫抑制剂用药产生影响。

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