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根据大型科研项目及其风险的特点,提出其风险损失主要体现于费用风险,费用风险预测是风险评估的重要内容;对多种费用预测方法进行比较分析,阐述了灰色系统理论应用于费用风险预测的科学合理性;最后构建了基于灰关联度的大型科研项目费用风险预测模型,并应用于实践,较好地解决了相似项目选取、项目总费用和各期费用估算,以及费用波动的预测问题,具有一定的实用价值。