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苦瓜的性别分化过程要先经过一个两性期，再分别向雄性或雌性的方向发育。对两性期和雄，雌花早期发育的3个典型时期的花蕾进行毛细管电泳分析，结果表明，一种分子量为11kD的蛋白质在雌花发育的3个时期都存在，并且含量变化很小，很可能是雌花程序表达中的一种“关键蛋白”；类似地，一种分子量为30kD的蛋白质很可能是雄花程序表达中的一种“关键蛋白”。此外，蛋白质合成抑制剂亚胺环己酮抑制离体两性花的体外性别分化，而核酸合成抑制剂3－脱氧腺苷则不影响两性花的体外性别分化。