【摘 要】
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目的 探讨沙眼衣原体omp1基因VS1-VS2序列基因分型和VS1-VS2基因突变率.方法 巢式PCR扩增omp1基因的VS1-VS2序列,自动测序仪测序,运用DNAstar软件进行临床菌株与标准菌株序列
【机 构】
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广东省皮肤性病防治中心,广州,佛山市皮肤病防治所,珠海市慢性病防治所
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目的 探讨沙眼衣原体omp1基因VS1-VS2序列基因分型和VS1-VS2基因突变率.方法 巢式PCR扩增omp1基因的VS1-VS2序列,自动测序仪测序,运用DNAstar软件进行临床菌株与标准菌株序列的比对.结果 99株临床标本分离株扩增出约453 bp大小的VS1-VS2片段.与标准株比对,除3株测序出现双峰无法确定基因型外,96株菌株分为9个型,以F型29株(30.2%)、E型22株(22.9%)、J型19株(19.8%)、D型12株(12.5%)和H型8株(8.3%)为主.序列分析发现7株存在VS1区碱基的突变或插入,多为有义突变,突变率为7.3%,多见于D、E、F和H型.结论 沙眼衣原体omp1基因序列分析在分子流行病学上具有一定意义.
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