【摘 要】
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采用RT-PCR、cDNA末端快速扩增法(RACE),克隆了象耳豆根结线虫生长发育关键基因actin的全长cDNA序列(登录号:KF534787),并与NCBI核酸数据库进行序列比对,结果表明:序列全长12
【机 构】
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海南大学环境与植物保护学院,海南省农科院农业环境与植物保护研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金(31260424);公益性行业(农业)科研专项(201103018);“十二五科技支撑项目”(2012BAD19B06-07)
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采用RT-PCR、cDNA末端快速扩增法(RACE),克隆了象耳豆根结线虫生长发育关键基因actin的全长cDNA序列(登录号:KF534787),并与NCBI核酸数据库进行序列比对,结果表明:序列全长1298 bp,包含一个全长1125 bp的开放阅读框ORF,编码375个氨基酸,起始密码子在82位,终止密码子在1207位,与已知的其它物种的actin具有高度的保守性,与马铃薯腐败线虫和松才线虫actin的同源性分别为99.20%和98.67%,与秀丽隐杆线虫、人类相似性分别达到98.67%和97.33%。系统发育分析表明,象耳豆根结线虫actin可能是β-actin,同时也发现了象耳豆根结线虫actin与人类的胞质actin(β-actin)更相似。本研究填补了GenBank数据库中象耳豆根结线虫内标参照基因的空白。
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