【摘 要】
：
水稻基因组序列中蕴藏着生理、遗传、发育、进化和与重要经济性状相关的许多生物学信息. 籼稻亚种Oryza Sativa ssp. indica在中国和亚洲其他地方广泛种植. 通过全基因组霰弹
【机 构】
：
中国科学院基因组信息学中心暨北京华大基因研究中心,杭州华大基因研究中心;国家杂交水稻研究开发中心,;中国科学院遗传研究所,;中国科学院基因组信息学中心暨北京华大基因研究中心;神州数码,;中国科学院计算
论文部分内容阅读
水稻基因组序列中蕴藏着生理、遗传、发育、进化和与重要经济性状相关的许多生物学信息. 籼稻亚种Oryza Sativa ssp. indica在中国和亚洲其他地方广泛种植. 通过全基因组霰弹法, 得到了这一亚种的基因组框架序列. 共完成430万个成功反应, 总读长为2214.9 Mb, 其中籼稻亚种93-11的成功反应有330万个, 总读长1797.4 Mb, 初步拼接得到了409.76 Mb的非冗余序列, 大约覆盖了水稻全基因组的95.29%, 碱基准确率大于99%. 通过与公共数据库中籼稻indica和粳稻japonica亚种的BAC克隆比较, 证实了基因组框架图的覆盖率、序列分布的随机性和拼接软件BIG-ASSEMBLER的准确性. 在框架图中, 鉴定了96.3%的全长cDNA, 96.4%的遗传标记(STS, STR, RFLP), 94.0%的EST和94.9%的单基因簇(unigene). 初步分析表明, 该框架序列已经达到了国际同行所认同的标准. 框架图的公布无疑为水稻生物学研究提供了基因组学和遗传学方面的基本信息.
其他文献
《义务教育学校校长专业标准（试行）》（征求意见稿）中阐述的基本理念是“以德为先、育人为本、引领发展、能力为重、终身学习”，既明确了校长的使命和责任，又对校长提出了任职专业要求，其中“引领”发展是校长区别于教师的重要标志。 引领与管理是学校发展的“两翼” 引领学校发展的本质特征 一是前瞻性，即引领学校发展必须有一个愿景规划。这个愿景要跟社会发展趋势，以及社会对未来教育发展的要求保持一致。引领就是
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
Elementary siphons are useful in the development of a deadlock prevention policy for a discrete event system modeled with Petri nets.This paper proposes an algo
运用统计方法,建立了不同时空尺度的数字月晴空指数估算模式DCIM.利用克立克(Kriging)插值法,制作了我国1 km×1 km全年各月气候平均晴空指数空间分布图.结果表明:分布图能较
合成了以甲酚红和钙黄绿素作为电子给予体,以8-羟基喹啉作为电子接受体的有机可逆热色性材料,并对材料进行了DSC测定.
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
In previous evacuation flow planning, a system optimal dynamic traffic assignment(SODTA) did not consider the exogenous costs caused by potential traffic accide