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由于种子自身特性和农作物生长过程的复杂性,种子真假和质量优劣的认定比较困难。同时,对于因种子质量造成的损失也不易计算。在种子质量纠纷案件的审理中应适用举证责任倒置的原则,由种子经营者承担证明种子质量的责任。种子质量纠纷是违约纠纷与侵权纠纷的竞合。解决种子质量纠纷途径主要有三:协商和解、申请调解与仲裁起诉。