【摘 要】
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不同的品种抗性不同,为进一步探究不同火龙果品种之间的抗性差异,为后续火龙果抗性育种提供参考,该研究利用Illumina HiSeq 2000测序平台对\'普通白肉\'(BR)和\'厄瓜多尔黄龙\'(EY)两个品种进行转录组测序分析,并参考GO Ontology、KEGG等公共数据库对差异表达基因进行功能分类与富集分析.结果表明:(1)BR与EY共有14248个差异基因,其中5446个基因上调,8802个基因下调.(2)相关GO功能分析表明这些差异基因主要参与酶催化活性、细胞组分、代谢过程等
【机 构】
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广西壮族自治区中国科学院 广西植物研究所,广西 桂林541006;广西喀斯特植物保育与恢复生态学重点实验室,广西壮族自治区中国科学院 广西植物研究所,广西 桂林541006;广西壮族自治区中国科学院
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不同的品种抗性不同,为进一步探究不同火龙果品种之间的抗性差异,为后续火龙果抗性育种提供参考,该研究利用Illumina HiSeq 2000测序平台对\'普通白肉\'(BR)和\'厄瓜多尔黄龙\'(EY)两个品种进行转录组测序分析,并参考GO Ontology、KEGG等公共数据库对差异表达基因进行功能分类与富集分析.结果表明:(1)BR与EY共有14248个差异基因,其中5446个基因上调,8802个基因下调.(2)相关GO功能分析表明这些差异基因主要参与酶催化活性、细胞组分、代谢过程等,其中参与氧化还原酶活性的349个差异基因在BR中表达量上调.(3)KEGG通路分析显示,大部分差异基因富集在新陈代谢和生物合成等,其中参与角质、木栓质和蜡质生物合成的差异基因有12个,如CYP86和CER1等.参与氧化还原酶活性的差异基因在BR中较EY表达量上调,且显著富集,表明BR与EY在生长发育和细胞代谢过程差异显著.参与角质、木栓质和蜡质生物合成的差异基因在BR中表达量上调,此类基因在BR中具有较高的表达量且显著富集,表明BR可能具有较强的抗旱和抗病能力.
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