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流感病毒核蛋白和M蛋白决定了病毒的型特异性,也是根据流感病毒核蛋白抗原性的不同,将其分为A、B、C3型。流感病毒的核蛋白是CTL反应的主要靶抗原,能诱导机体的细胞免疫,能产生种间交叉的免疫保护,不受表面结构蛋白亚型的影响;且流感病毒核蛋白通过病毒的RNA参与病毒生活周期的多个阶段,在流感病毒的感染中起着不可替代的作用。