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利用ISSR分子标记对来自10省区15个南方红豆杉代表性种源,研究揭示其种源遗传多样性及地理变化、种源遗传分化等。结果表明：南方红豆杉具有丰富的遗传多样性,物种水平上的遗传多样性为0.4192,多态百分率（PPL）、Nei’s基因多样性（HE）和Shannon信息多样性指数（I）分别变化在80.00%～93.33%、0.3393～0.3873、0.4926～0.5615。南方红豆杉种源遗传多样性受其产地经度和纬度非线性共同影响,偏南和偏西地区种源的遗传多样性较低,而偏东和偏北地区种源遗传多样性则较高。因试