基于高通量测序分析牛呼吸系统疾病鼻咽微生物多样性和功能预测研究

来源 :畜牧与兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liyang0ly
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为研究患呼吸系统疾病(BRD)的牛鼻咽部微生物的多样性及其基因功能,搜集贵州省不同地区3个牛场的患病牛鼻拭子(分别为R1、R2和R3组),利用Illumina高通量测序技术鉴定牛鼻咽部微生物多样性.平均得到细菌类有效序列64128条,聚类为3675个操作分类单元(OTUs);真菌类有效序列65472条,聚类为2646个OTUs.经分类学鉴定,细菌类属32个门、52个纲、124个目、233个科和582个属;真菌类属14个门、32个纲、97个目、223个科和407个属.细菌中的优势菌群为拟杆菌门(19.19%~47.15%)和变形杆菌门(16.04%~48.53%);属水平下,致病性细菌有支原体(0.68%~7.82%)、曼氏杆菌(0.19%~3.06%)、不动杆菌(0.74%~10.92%)、巴氏杆菌(0.44%~3.97%)和金黄杆菌(0.25%~2.75%)等.真菌中的优势菌群为子囊菌门(40.73%~61.4%)和担子菌门(6.88%~24.3%);属水平下,致病性真菌有曲霉菌属(1.19%~16.26%)、假丝酵母属(0.19%~7.6%)和克柔氏菌属(2.28%~45.1%)等.细菌类KEGG功能分类注释显示,R1组和R2组代谢类的相关通路丰度增加,R3组疾病感染、信号转导等相关通路丰度增加.真菌功能注释显示3组样品中均存在动物病原菌丰度增加.结果 表明,患BRD牛鼻咽部微生物组成相似,但相对丰度存在差异;除常见的菌群外,还存在致病性细菌和真菌.
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旨在研究重组绵羊肺表面活性物质结合蛋白A (rSP-A)对中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)活性及淋巴细胞体外增殖的影响,初步分析rSP-A的抑菌活性.使用绵羊肺炎支原体(Mo)感染体外培养的绵羊外周血中性粒细胞以刺激其释放NE,然后应用底物显色法对比分析不同浓度rSP-A对NE活性的影响:使用MTT比色法测定rSP-A对体外培养的绵羊外周血淋巴细胞增殖活性的影响;使用酸化法和平板菌落计数法测定rSP-A对Mo代谢与增殖的影响;应用平板菌落计数法对rSP-A的抑菌活性进行初步分析.NE活性检测结果表明,rSP-
为了解决闽楠苗木繁育中常因水分亏缺导致生长不良及死亡的问题,以1年生闽楠幼苗为材料,研究干旱胁迫下施加不同浓度外源亚精胺对闽楠幼苗光合生理的影响,探究亚精胺对闽楠幼苗干旱胁迫的缓解作用.结果表明:外源亚精胺处理可在一定程度上提高Pn、Gs及抗氧化酶活性,降低Pro和MDA含量,缓解干旱胁迫对闽楠的影响;其中0.1 mmol/L浓度的亚精胺效果最好,其处理后Pn和WUE明显高于其他处理,尤其到干旱胁迫后期效果显著,胁迫第32天Pn和WUE分别比CK高82.1%、123.7%,差异显著;抗氧化酶SOD、CAT
为了掌握豫西地区猪伪狂犬病病毒(PRV)的流行特征,采用PCR方法对2016-2020年采集自豫西地区的152份临床病料进行了PRV病原学检测,并对PCR阳性样品进行了病毒的分离鉴定与gE基因遗传变异分析.结果:152份临床病料样品中PRV野毒株阳性率为13.82%,不同区县中以嵩县(21.05%)和栾川县(20.0%)的阳性率较高,不同年份中以2017年(20.69%)和2018年(19.05%)的阳性率较高;8个分离毒株均能引起BHK-21细胞发生变圆变大、聚集拉网、脱落等典型细胞病变,其每毫升TCI
为明确增施氮肥对镉迫下龙葵光合生理的影响,以龙葵为试验材料,分析增施不同浓度氮肥对Cd胁迫下龙葵叶绿素含量、叶绿素荧光和捕光色素分子内禀等特性的影响.结果表明:镉胁迫下龙葵叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜素含量均随施氮量的增加而逐渐上升;增施氮肥后,龙葵光系统Ⅱ最大光化学量子产量、PSⅡ有效光化学量子产量、电子传递速率、捕光色素分子总数、处于最低激发态的捕光色素分子数和光化学反应耗散比例增大,非光化学淬灭系数、捕光色素分子本征光能吸收截面、捕光色素分子有效光能吸收截面和天线热耗散比例减小.可见,增施氮肥对镉胁
为了解云南省家禽中弓形虫感染的流行情况,于2018年3月至2020年12月,在云南省家禽养殖比较集中的地区,从8个规模化家禽养殖场、10个地方鸡养殖场及部分散养户中采集各种家禽血样及土壤样品2802份,采用间接血凝试验(IHA)和套式PCR方法对弓形虫的抗体和核酸分别进行检测,并对核酸检测为阳性的样品通过PCR-RFLP进行了基因分型研究.结果 显示:云南省家禽中弓形虫平均抗体阳性率为4.48%,血样、土壤核酸的平均阳性率分别为1.40%和2.74%;不同饲养模式、不同品种、不同地区之间存在一定差异,但地
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为探讨湿生观赏植物水生鸢尾、美人蕉、再力花、千屈菜和蒲草的抗重金属Cd污染能力,采用盆栽试验,分析不同浓度Cd处理对5种植物生理生化指标的影响.结果表明:在高浓度处理下,5种植物地上部与根系的Cd积累量的高低顺序依次是美人蕉、千屈菜、蒲草、水生鸢尾、再力花;随着Cd处理浓度的增加,湿生植物美人蕉、千屈菜、蒲草、再力花中SP含量呈现先增加后降低的趋势,而水生鸢尾总体呈现缓慢的递增趋势;相比再力花中Pro含量随Cd浓度的增加所呈现的先增后减趋势,美人蕉、千屈菜、蒲草、水生鸢尾中均呈现递增趋势.5种观赏植物叶片
为探究在母鼠妊娠期补充高羊毛氨酸硒对新生乳鼠肠道抗氧化功能的影响,18只健康Wistar孕鼠被随机平均分成缺硒组(0.03 mg/kg)、正常硒对照组(0.15 mg/kg)和富硒组(1.5mg/kg),母鼠分娩后第4天对新生乳鼠进行称重,安乐死后测定新生乳鼠的胸腺指数和脾脏指数,并检测新生乳鼠十二指肠和空肠的谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)、过氧化氢酶(CAT)、总超氧化物歧化酶(T-SOD)的活性,以及总抗氧化能力(T-AOC)和丙二醛(MDA)含量.结果 显示:与正常硒对照组相比,缺硒组和富硒组新
为了解河南省屠宰场生猪肉孢子虫病流行情况,于2018年6月-2019年10月,采用猪源肉孢子虫双重套式PCR检测试剂盒对采自河南省11个地区62个屠宰场的2038份样品进行肉孢子虫的检测分析.结果 显示:肉孢子虫阳性屠宰场37个,场阳性率59.7%,阳性样品599份,样品平均阳性率为29.4%;规模场(存栏500头以上)阳性率为27.7%,散养户(存栏500头以下)阳性率为32.3%,且二者差异显著(P<0.05);阳性样品均为米氏肉孢子虫,未检测到猪人肉孢子虫;不同季节肉孢子虫阳性率差异不显著,春季最高