【摘 要】
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【目的】通过比较不同时期的H9N2亚型禽流感流行毒株HA基因的分子特征和变异频率,揭示免疫压力下病毒的遗传演化趋势。【方法】选取源于课题组的40株鸡源H9N2毒株,以及从Gen
【机 构】
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山东农业大学动物科技学院; 山东农业科学院家禽研究所; 山东省健牧生物药业有限公司;
【基金项目】
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国家自然科学基金(31372332);科技部农转资金(SQ2013ECC600059);山东省科技攻关重点支持项目(2009GG10009006);济南市成果转化支持项目(2012CG92)~~
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【目的】通过比较不同时期的H9N2亚型禽流感流行毒株HA基因的分子特征和变异频率,揭示免疫压力下病毒的遗传演化趋势。【方法】选取源于课题组的40株鸡源H9N2毒株,以及从Gen Bank下载的136株中国鸡源H9N2流行毒株和7株经典毒株的序列,利用Lasergen 7.1和MEGA 5.1等软件,对其HA基因进行系统演化、分子特征和变异频率分析。【结果】系统发育分析表明,近20年的鸡源H9N2流行株分属于BJ94、Y280和S2等谱系,优势流行株的分布与年代密切相关。氨基酸序列比较显示,H9N2病毒不同谱系之间具有各自的特征,且存在着明显的氨基酸变异积累。以Ck/BJ/1/1994 HA基因为参照,1994–2014年间,H9N2流行株核苷酸和氨基酸的年均进化率分别为5.73×10–3和4.25×10–3。其中,2011–2014年的核苷酸（氨基酸）年均进化率为6.35×10–3(5.32×10–3),明显高于2006–2010年5.22×10–3(3.70×10–3),更显著高于疫苗推广初期1999–2005年的0.74×10–3(0.50×10–3)。【结论】H9N2疫苗株和流行毒株的不匹配是病毒变异频率加快的重要原因。
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