【摘 要】
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目的 基于GEO数据库多芯片联合分析与网络药理学相结合,探索黄芪治疗心肌缺血再灌注损伤(Myocardial is-chemia-reperfusion injury,MIRI)的作用机制.方法 通过GEO数据库获得GSE108940与GSE58486芯片数据,利用R语言综合分析筛选出MIRI的差异表达基因,使用Genecards与OMIM获取MIRI的靶点,在TCMSP和BATMAN-TCM中获取黄芪的有效成分与靶点,进行PPI分析,随后导入至Cytoscape 3.8.1中,分析得出核心靶点,利用DA
【机 构】
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西南医科大学附属中医医院,四川泸州646000;国家中医临床研究基地,四川泸州 646000
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目的 基于GEO数据库多芯片联合分析与网络药理学相结合,探索黄芪治疗心肌缺血再灌注损伤(Myocardial is-chemia-reperfusion injury,MIRI)的作用机制.方法 通过GEO数据库获得GSE108940与GSE58486芯片数据,利用R语言综合分析筛选出MIRI的差异表达基因,使用Genecards与OMIM获取MIRI的靶点,在TCMSP和BATMAN-TCM中获取黄芪的有效成分与靶点,进行PPI分析,随后导入至Cytoscape 3.8.1中,分析得出核心靶点,利用DAVID数据库进行GO与KEGG富集分析,对核心成分及靶点进行CDOCKER对接验证.结果 总共筛选出黄芪的12个有效成分及15个关键靶点,GO富集分析主要涉及分子功能(Molecular Function,MF)条目71个,生物学过程(Biological Process,BP)条目173个,细胞组分(Cellular Component,CC)条目31个,KEGG信号通路主要有27条,CDOCKER结果显示黄芪的核心成分与核心靶点展示出了较好的亲和力.结论 黄芪通过抑制炎症、抑制细胞凋亡等生物学途径干预MIRI,机制可能主要与NOD样受体信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路等信号通路有关.
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