创新系统的功能分析方法是近些年来新出现的一种描述和分析创新系统运行机制的研究框架。本文在介绍创新系统功能分析方法的基础上,根据我国新能源汽车产业的特点,对其产业创新系统的主体、网络和制度,系统所具有的功能,以及系统功能实现面临的主要促进和阻碍因素进行分析。本文认为,我国新能源汽车产业创新系统主要具有七个功能,分别是:知识获取与扩散、合法化、促进市场形成、基础设施与支撑平台建设、资源流动、产业链整合、正向外部性创造。研究发现,我国新能源汽车产业发展的优势主要在于潜在市场需求巨大、政府支持意愿强烈、企业参与态度积极。产品和配套设施成本过高、地方保护主义和商业模式落后是制约我国新能源汽车产业创新系统功能实现的三个主要阻碍因素。本文的研究为我国新能源汽车产业的发展与政策制定提供了有益的借鉴和启示。