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“学科专业建设”这一用法容易引出一些歧义。学科与专业的内涵各不相同，但两者间有内在联系。高校中学科与专业的实际划分的依据不同。地方高校学科建设与专业建设的矛盾体现为：教育资源的相争；工作目标不同；组织结构型态的相异；构成要素的分割。学科建设与专业建设整合的原则为学科建设以生成符合社会需要的专业为导向，专业建设以学科为依托。