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目的：首次对川产道地药材川牛膝表观遗传多样性进行研究,建立并优化川牛膝甲基化敏感扩增多态性技术（MSAP）最佳反应体系。方法：以川牛膝苗期叶片为材料,利用正交试验设计对川牛膝MSAP反应体系中预扩增和选择性扩增中关键影响因素进行考察,建立川牛膝MSAP反应最佳体系。结果：川牛膝MSAP最佳反应体系为：酶切体系（20μL）,300 ng DNA、1.5μL Eco RI、1.5μL Hpa II或1.5μL Msp I（Hpa II）;连接体系（25μL）：15μL酶切产物、1μL Eco RI adapt