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清华大学化工系生物化工研究所始建于1984年。以“继承＋创新”为发展宗旨．研究所在科研方面突出化学工程与生物技术和生命科学的交叉，开拓生物化工领域的前沿研究；在教育方面着重培养生物与化工交叉领域的复合型和研究型人才，引领学生从事生物化工新工艺、新产品、新技术的基础和应用研究，同时锻炼学生在生产及技术经济管理方面的能力。1990年获得生物化工硕士点授予权，1999年开始获得生物化工博士学位授予权，2007年获得全国重点学科。