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“十一五”规划明确提出要全面提升自主创新能力,而创新投入是一个直接影响创新能力提升的至关重要的问题。目前我国两部地区创新投入中存在着三大问题：一是创新投入运行机制上的高度计划性;二是运行结构上存在着不合理性;三是创新投入渠道的单一性。因此,建立科学规范的创新投入机制和相应的监督机制,进而建立起适合西部地区的创新投入的长效机制就显得尤为重要了。