目的研究广西风疹病毒基因型别及特征,为预防和控制风疹提供分子流行病学基线数据。方法对2013~2014年广西出疹病例中风疹病毒核酸阳性的病原学标本,使用淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞(Vero Cell Transfected to Express the Human Signaling Lymphocyte Activation Molecule,Vero/SLAM)进行病毒分离,再应用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)对分离到的风疹病毒进行E1基因的945个核苷酸(8633~9577nt)片段扩增,并对其PCR产物进行序列测定和分析。结果从收到的148份风疹核酸阳性咽拭子中分离培养出119株风疹病毒株,其中20株为1E基因型,99株为2B基因型,来源于9个不同的地市。其中2B基因型风疹毒株与其他省2B基因型毒株的同源性达98.77%~99.86%。所有119株风疹分离株在N-型糖基化位点和抗原表位位点均未发生突变,6株分离株在血凝抑制位点和中和位点上发生了突变,且均为2B基因型。结论广西2013~2014年风疹病毒在人群中以1E基因型和2B基因型共存循环,2B基因型为优势基因型,1E基因型可能正在逐步被2B基因型所代替。E1基因氨基酸序列虽保守,但亦有些毒株发生突变,今后应继续加强与完善广西风疹病原学监测。