【摘 要】
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植物咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用.本研究采用生物信息学方法对芍药等8种植物COMT基因编码的氨基酸序
【机 构】
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扬州大学园艺与植物保护学院,扬州,225009
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植物咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用.本研究采用生物信息学方法对芍药等8种植物COMT基因编码的氨基酸序列进行比对,进而对其蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构与三级结构进行了预测与分析.结果 表明,芍药等8种植物COMT基因编码氨基酸的一致性可达65.91％,平均相对分子量为39 437.79 Da,带有酸性等电点,含量最丰富的氨基酸为亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),无信号肽,无跨膜结构域,磷酸化位点数量最多的为丝氨酸和苏氨酸,定位于细胞骨架和细胞质中可能性最大,二级结构则以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维结构具有一定的相似性.这一结果为今后深入开展植物COMT基因功能研究提供了科学依据.
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