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线粒体基因atp6与多种植物细胞质雄性不育（CMS）关系密切。为探索atp6基因致烟草CMS的潜能,以2对烟草不育系和相应保持系为材料克隆atp6基因,测序结果显示不育系与保持系atp6基因间有6个碱基差异。进一步的生物信息学分析结果表明,6个碱基差异导致4个预测氨基酸残基差异及差异残基所处区域的亲/疏水性改变,不育系atp6基因预测蛋白在二级结构和结构域上均呈现出周期结构（主要为α-螺旋）增加而非周期结构（主要为无规卷曲）减少的趋势,不育系atp6基因的碱基差异能在一定程度上引起编码亚基空间结构类型发生