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针对具有大介电常数介质粗糙面的电磁散射问题，提出了灵活的广义最小余量法（FGMRES）和基于物理意义的双网格法（PBTG）的混合算法，并对介质粗糙面的电磁散射系数和发射率进行了仿真。在PBTG算法的基础上，应用了FG—MRES迭代算法求解矩阵方程。通过PBTG算法加速矩阵向量积和FGMRES算法加快迭代收敛速度，达到减少计算量和加快计算速度的目的。通过计算实例可知，FGMRES相对其他迭代法具有很好的收敛性，耗时较少，在满足精度要求的前提下，较其他迭代法明显加快了计算速度，并有效地模拟了介质粗糙面的电磁散