云南省昆明市HIV-1流行株pol基因序列特征分析

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目的了解云南省昆明市人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)的亚型分布特征及其pol结构基因的变异特征。方法随机抽取2015―2019年昆明市抗病毒治疗半年以上的样本390例,收集其流行病学信息,血浆提纯HIV-1 RNA,采用巢式聚合酶链式反应扩增HIV-1 pol基因,应用Genotyping Tool、BLAST在线分型工具及MEGA 6.06软件进行基因分型,运用MEGA Distance程序计算基因距离,Entropy程序分析氨基酸多态性,进而对HIV-1流行株的pol基因序列特征进行分析。结果成功扩增获得pol基因序列318例,云南省昆明市的HIV-1亚型主要为B亚型占比3.1%,C亚型占比4.4%,CRF01AE占比26.1%,CRF07BC占比20.4%,CRF08BC占比42.8%,其他亚型占比3.1%。各个亚型在性别、年龄及感染途径的构成上差异均有统计学意义(均有P<0.001)。CRF01AE、CRF07BC、CRF08BC的基因距离分别为(0.018±0.008)、(0.015±0.006)和(0.006±0.004)bp,差异均有统计学意义(均有P<0.01)。CRF01AE亚型中静脉药瘾感染者与性接触感染者中共有45个位点的氨基酸差异存在统计学意义(均有P<0.05),异性性传播与同性性传播中共156个位点有差异。结论昆明市HIV-1亚型分布复杂多样,以CRF08BC为主,传播途径以异性性传播为主,CRF01AE亚型为昆明地区变异程度较高的流行株,不同感染途径毒株的氨基酸突变位点存在差异,应密切监视其变化。
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