【摘 要】
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目的基于公共数据库中恶性胸膜间皮瘤(MPM)的基因芯片和二代测序数据集,筛选与MPM发生发展相关的信号通路、生物标志物和预后相关基因。方法从基因表达数据库下载MPM基因芯片表达数据集GSE51024和GSE2549,分别包括MPM患者82和49例;从癌症基因图谱(TCGA)数据库下载86例MPM患者的RNA测序数据。通过Rstudio 4.0软件对GSE51024数据集采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)、差异表达基因(DEGs)筛选进行hub基因筛选与识别,并进行基因集富集分析(GSEA),探究相关
【机 构】
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杭州医学院（浙江省医学科学院）职业病防治研究所
【基金项目】
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浙江省医学支撑学科建设计划劳动卫生学(11-ZC02),中日加强石棉相关癌症诊断能力项目。
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目的基于公共数据库中恶性胸膜间皮瘤(MPM)的基因芯片和二代测序数据集,筛选与MPM发生发展相关的信号通路、生物标志物和预后相关基因。方法从基因表达数据库下载MPM基因芯片表达数据集GSE51024和GSE2549,分别包括MPM患者82和49例;从癌症基因图谱(TCGA)数据库下载86例MPM患者的RNA测序数据。通过Rstudio 4.0软件对GSE51024数据集采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)、差异表达基因(DEGs)筛选进行hub基因筛选与识别,并进行基因集富集分析(GSEA),探究相关
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