用多元矢量自回归模型推断微生物相互作用关系

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识别微生物相互作用关系对理解微生物社团的结构和功能非常重要,一般的推断微生物相互作用关系的计算方法都是基于微生物个体相似性来提出的。比起来自多个不同社区的相互作用网络,一个复杂社区的时间动态性可以揭示更为复杂的相互作用关系。尽管已经提出了很多相似性方法来分析时间序列数据,但是没有有效的多元统计方法来推断和评估作用关系的统计显著性。在本文中,我们提出从人类肠道微生物的时间序列数据来推断出微生物动态相互作用,我们使用多元统计方法——矢量自回归(MVAR)模型,并应用它对重复抗生素扰动的人类肠道微生物时间序列数
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