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鼠疫病原体的宿主，是鼠疫自然疫源地的稳定因素和基本条件。一定的地理景观条件下，必然具有特定宿主，媒介和病原体类型，并且构成一定的生物群落，形成一定类型的鼠疫自然疫源地，这是物种间在长期生物进化过程中演化的结果。在鼠疫自然疫源地内，特别是单宿主疫源地内，当动物鼠疫大流行时，某些小型啮齿类和食肉类动物也可以感染鼠疫病原体，并且可以出现猛烈的动物鼠疫流行，但是却不能长期保存鼠疫病原体，对鼠疫自然疫源性的保持只起辅助作用。可是即使是次要宿主，当其大量繁殖时，甚至在一般情况下，一旦卷入动物鼠疫流行，往往成为人间鼠疫