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用136个RAPD引物对玉蜀黍属大刍草和玉米种质基因组DNA的多态性进行检测，共得到5303条条带，其中多态性带4500条。遗传相似系数分析结果表明，玉米与大刍草种质遗传相似性系数变幅为0．585～0．809，相同种遗传相似性系数为0．767-0．809，而种间或亚种问的相似性系数为0．585～0．745，表明利用RAPD技术能准确地揭示出玉米与大刍草种间的遗传关系。聚类结果表明，玉蜀黍属内所有大刍草和玉米可分类为繁茂亚属和玉蜀黍亚属，繁茂亚属包括四倍体多年生类玉米种、二倍体多年生类玉米种、繁茂类玉米种和