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为探明毛序棘豆中内生真菌的种属及种群分布情况，对采集于甘肃省通渭县毛序棘豆样品，运用表面消毒法消毒样品后进行内生真菌分离，采用形态学和ITS序列分析技术对所得菌株进行种属鉴定，并通过MEGA5.05软件进行系统进化分析。结果显示，从毛序棘豆(根、茎、叶)中共分离得到内生真菌29株，经鉴定，分属于4纲、5目、6科、10属；其中茎的分离率(39.13%)最高，根(23.91%)次之，叶(11.11%)最少；而链格孢属(Alternaria sp.)和镰刀菌属(Fusarium sp.)是毛序棘豆内生真菌的优势