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实验室前身是内蒙古民族大学药物化学与药理学研究所，该研究所于2012年1月正式成立。依托内蒙古民族大学中（蒙）药化学与药理学学科，整合内蒙古民族大学医学院、蒙医药学院、附属医院、生命科学学院、化学学院相关的高级专门人才，经过几年的探索，该研究所逐渐形成具有鲜明民族特色、浓厚文化底蕴的创新蒙药研究团队。