【摘 要】
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为了解福建白兔钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin,CAST)基因分子基础,应用RT-PCR和克隆测序从肌肉组织总RNA中克隆出福建白兔CAST基因的cDNA序列并进行分析.通过荧光定量PCR测定福建白兔不同组织CAST基因mRNA表达谱.结果 显示:该基因序列长度为2505 bp(GenBank登录号:MT457404),其中5\'非翻译区128 bp,3\'非翻译区223 bp,2154 bp的开放阅读框,编码717个氨基酸;序列分析表明,福建白兔与已报道的兔(NM_001082270.1
【机 构】
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福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福建福州350013;龙岩市农业农村局,福建龙岩364000
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为了解福建白兔钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin,CAST)基因分子基础,应用RT-PCR和克隆测序从肌肉组织总RNA中克隆出福建白兔CAST基因的cDNA序列并进行分析.通过荧光定量PCR测定福建白兔不同组织CAST基因mRNA表达谱.结果 显示:该基因序列长度为2505 bp(GenBank登录号:MT457404),其中5\'非翻译区128 bp,3\'非翻译区223 bp,2154 bp的开放阅读框,编码717个氨基酸;序列分析表明,福建白兔与已报道的兔(NM_001082270.1)、人(NM_001750.7)、猴(XM_012638821.1)、猩猩(XM_014344954.2)、小鼠(NM_001301153.1)、大鼠(NM_001033716.1)、猫(XM_011284752.3)、狗(XM_005618083.3)、猪(NM_214067.1)、牛(NM_001030318.3)、绵羊(NM_001009788.1)、山羊(XM_018050015.1)和马(XM_023617937.1)的氨基酸序列同源性分别为99.5％、79.1％、80.4％、79.2％、71.6％、72.6％、77.6％、77.8％、76.8％、76.2％、75.9％、75.9％和78.2％.对13种组织的实时荧光定量PCR分析发现,90日龄福建白兔CAST mRNA表达量以肠组织最高,且极显著高于其他各组织(P＜0.01);各组织CAST基因的相对表达量总体趋势为:肠＞肺＞心、脾、垂体(后三者间表达差异不显著);肾中CAST mRNA表达量显著低于肠、肺、心、脾和垂体(P＜0.05),显著高于背肌、下丘脑、胃和肝(P＜0.05).研究结果为进一步开展CAST基因在肉兔肉质改善提供理论参考.
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