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新券效应与国债品种特征、投资者行为和市场微观结构均有密切关系。上交所和银行间国债市场的新券效应不仅存在共同点，也存在明显差异。在交易额占比最大的基准国债品种上，两个市场均表现出显著的新券效应。但由于投资者行为存在差异，上交所国债市场的新券效应更倾向于中长期国债品种，而银行间国债市场的新券效应更倾向于短期国债品种。而且，上交所国债市场的指令驱动交易方式便于连续交易和信息披露，方便考察新券效应，而银行间国债市场仅能在较短时间内考察新券效应。在上交所国债市场上，中长期国债与国债回购的利差更大，有利于现券回购套利