【摘 要】
：
目的:探讨建立适合我国国情的校园生物信息学平台的策略和方法.方法:以 Emboss分子序列分析组件、R数理统计分析组件、Bioconductor基因芯片分析组件、 Phylip分子进化研究工
论文部分内容阅读
目的:探讨建立适合我国国情的校园生物信息学平台的策略和方法.方法:以 Emboss分子序列分析组件、R数理统计分析组件、Bioconductor基因芯片分析组件、 Phylip分子进化研究工具、PostgreSQL关系数据库管理系统和Bioperl脚本语言为基本组件,在Linux操作系统上,将其编译、连接成为一个有机的校园生物信息学平台.结果:初步建成的校园生物信息学平台,可作为基于校园网的完整的核酸及蛋白质序列分析工具、基因芯片数据分析工具、对基因组数据进行多角度挖掘的工具、提供良好的新算法、新模型开发环境.开放的框架使平台具有良好的可扩展性及向后的兼容性.新开发的生物信息学工具可迅速整合进该平台.结论:用公开软件建立的校园生物信息学平台具有成本低和性能完善、优异的特点,对后基因组研究将起重要的支撑作用.
其他文献
胰十二指肠切除术(pancreaticoduodenectomy,PD)是治疗壶腹周围恶性肿瘤和某些良性疾病的主要方法.自1935年WhiPPle首次实施PD以来,随着外科技术的进步,PD的死亡率已降至5%以
目的 探讨汉族人维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)基因Fok I、Taq I位点基因多态性对宿主感染乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)慢性化结局的关联.方法 用病例-对照研
肺动脉高压(pulmonary artery hypertension,PAH)是指孤立的肺动脉血压增高,而肺静脉压力正常,主要原因是肺小动脉原发病变或其他的原发疾病而导致的肺动脉阻力增加,目前被划
目的 比较表皮生长因子受体(EGFR)和α-连接蛋白(α-cat)在正常结肠及结肠癌中的表达及其与结肠癌生物学行为的关系.方法 用SP免疫组织化学方法检测20例正常结肠和68例结肠癌
基于全方向反射镜的低损耗波导能够传输任何波长的光,一个潜在的应用是传输CO2激光束,从而拓展了空芯光纤的应用.
目的 探讨急性心肌梗死(AMI)患者发病第7天肌钙蛋白Ⅰ(cTnI)水平在预后中的判断价值.方法 161例AMI患者依照采取的治疗方法分为急诊冠状动脉介入(PCI)治疗组(35例),延期PCI组
2007年10月,中共厦门市委、市政府出台了~([1]),实施医疗重组计划.
该文提出一种新的基于可扩展散列表的倒排索引更新策略,使倒排索引具有良好的可扩展性.它既支持文档的插入、删除操作,又具有较高的查询效率和空间利用率.并在它的基础上,实
大型泵站的自动化监控系统一般包含供电系统自动化、PLC集散控制及数字视频闭路监视等几部分 ,本文以南京市某工程实例介绍大型泵站自动化的综合解决方案
Large-scale pump
介绍了一套在GE Smallworld GIS平台上开发的电网运行管理系统,该系统在一体化设计思路下采用了完全面向对象化的方法,将图形、数据紧密结合在一起作为一个对象处理,真正做到