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电子对抗的实际应用中为了完成信号的分类、解调任务，需要精确估计截获信号的码速率。针对数字通信中常见的MPSK、QAM信号，提出了一种基于余弦窗变换的码速率估计新算法。利用余弦窗变换确定信号相位跳变位置，进而利用谱分析精确估计码速率。理论分析证明了算法的有效性。仿真试验表明，当信噪比大于5dB时算法是有效的，且优于采用小波变换的方法。